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Nanopore PromethION 24 入駐貝納基因

新年好消息,Nanopore PromethION-24(以下簡稱P24)順利抵達貝納基因武漢總部。貝納基因Nanopore 測序平臺再添新成員。PromethION-24將與PromethION-beta攜手并行,共同為廣大新老客戶服務,在動植物和微生物基因組de novo組裝及重測序、轉錄組測序以及宏基因組測序等領域貢獻力量。
 
P24測序儀,具有24個流動槽,可以同時運行24張測序芯片,72小時能獲得3.6Tb的數據量。目前官方最高紀錄為3.8Tb,仍有進一步改進的空間,將來可能生成10Tb的數據。P24保持了納米孔測序實時,長讀長,直接對DNA和RNA分子測序,獲得堿基修飾信息等特點。仍然可以直接進行數據處理,在測序過程中實現實時的鑒定和比對分析。













貝納基因 Nanopore 測序的優勢

貝納基因做為國內首批引進 Nanopore PromethION 的測序平臺,擁有多年的高通量測序,三代測序和 Nanopore 測序,以及生物信息分析經驗,在Nature 和 Science 系列雜志發表多篇學術論文。
貝納基因使用 Nanopore 平臺完成數千份細菌基因組、宏基因組測序和數據分析;完成數千份全長轉錄組和 Direct 轉錄組測序分析。提出和推動基于Nanopore 測序的萬種微生物基因組完成圖計劃和10萬個人的 Nanopore 宏基因組計劃。
貝納基因使用 Nanopore 平臺完成全球第一個大型復雜植物基因組菊花基因組的組裝和后續分析工作。提出和推動千種本草基因組計劃,并構建藥用植物基因組數據庫,推動藥材研究的發展。
 

Nanopore 測序技術簡介
 
Nanopore是基于納米孔的單分子實時電信號測序技術。其技術原理是DNA 雙鏈在馬達蛋白的帶領下與鑲嵌在生物膜上的納米孔蛋白結合并解螺旋,在生物膜兩側電壓差的作用下,DNA 雙鏈以一定的速率通過納米孔通道蛋白,由于DNA 雙鏈上不同堿基化學性質存在差異,所以當單個堿基或DNA 分子通過納米孔通道時,會引起不同電學信號的變化。通過對這些信號進行檢測及對應,即可計算獲得相應堿基的類型,完成序列的實時測定。
 
Nanopore 測序特點

1)體積小
2)讀長長,比 PacBio測序的還要長平均讀長能夠達到幾十到上百 Kb,最長讀長能達到2 Mb以上。
3)能直接讀取出甲基化的胞嘧啶,不用像二代測序那樣需要事先對基因組進行 bisulfite 處理。
4)數據實時讀取,并且起始DNA在測序過程中不被破壞。
5)成本低,比 PacBio 測序便宜。
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