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原核轉錄組
 
基因表達、結構和功能研究
 
針對原核生物mRNA進行測序和分析。可用于:
表達分析:計算樣本中基因的表達量,鑒定樣品間差異表達基因,并進行差異表達基因的COG分類和GO、KEGG功能富集分析;
結構分析:優化已有基因結構、UTR注釋,進行操縱子預測、反義轉錄本預測、啟動子motif分析和變異檢測等。


 
產品特色


 
測序樣品在基因組上的覆蓋度差異
 
將測序序列比對到參考基因組上,沿基因組依據覆蓋深度繪圖。結合基因在染色體上的分布結構,可以直觀的反映樣品間的差異。


差異表達基因的COG分類

基于所有差異表達基因的COG注釋,進行COG分類統計。也可以根據您的需要,對比不同分組間,差異表達基因的COG分類差異。


操縱子結構預測

基于轉錄組數據,可以預測操縱子的結構。一般功能相近的基因會在一個操縱子里面,幫助您解析基因調控的機制。

啟動子motif預測

啟動子區域有一些保守的motif,在基因轉錄調控中起重要的作用。通過啟動子motif預測,可以完善基因結構注釋,發現新的調控原件。
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